39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0065 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
182 aa  358  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.23 
 
 
187 aa  117  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.79 
 
 
187 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.2 
 
 
184 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  35.37 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.65 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.01 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  83.6  2e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.78 
 
 
182 aa  83.2  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  34.01 
 
 
188 aa  82.8  3e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  32.28 
 
 
201 aa  78.6  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.64 
 
 
187 aa  76.6  2e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.94 
 
 
183 aa  75.9  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.67 
 
 
202 aa  75.9  3e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.06 
 
 
202 aa  74.7  7e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  34.93 
 
 
184 aa  69.7  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.57 
 
 
184 aa  65.5  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  64.7  7e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.33 
 
 
183 aa  62  4e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32 
 
 
184 aa  61.2  8e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.86 
 
 
182 aa  59.7  2e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.26 
 
 
177 aa  57.8  9e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.91976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  57.4  1e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.34 
 
 
176 aa  53.5  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  28.08 
 
 
216 aa  51.6  5e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  27.01 
 
 
177 aa  49.7  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.58 
 
 
179 aa  48.9  4e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.88 
 
 
196 aa  47.8  9e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  24.39 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.42 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  31.13 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.79179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.37 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  24.67 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  31.46 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.12 
 
 
183 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.36 
 
 
316 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.73 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  29.14 
 
 
270 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  25.61 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>