91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0024 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
87 aa  168  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  45.33 
 
 
127 aa  76.6  1e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  44.32 
 
 
118 aa  74.3  6e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.34025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  43.24 
 
 
121 aa  68.9  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  43.06 
 
 
130 aa  68.2  3e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  43.06 
 
 
130 aa  67  7e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0426  hypothetical protein  64.58 
 
 
50 aa  65.1  3e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  38.96 
 
 
132 aa  64.7  4e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  36.25 
 
 
142 aa  63.9  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  36.05 
 
 
120 aa  62.4  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  46.77 
 
 
111 aa  61.6  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  58.2  4e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  38.96 
 
 
129 aa  58.2  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.21 
 
 
386 aa  57.8  5e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  35.37 
 
 
89 aa  57.8  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  38.89 
 
 
137 aa  57.4  7e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  41.25 
 
 
94 aa  57.4  7e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  40.3 
 
 
133 aa  56.6  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  56.6  1e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  29.58 
 
 
131 aa  56.2  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  35.62 
 
 
124 aa  55.8  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  32.89 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  38.1 
 
 
386 aa  54.7  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  36.14 
 
 
130 aa  54.7  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  36.47 
 
 
132 aa  54.3  6e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.33286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  9.23081e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.36995e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  32.5 
 
 
93 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67002e-43 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  35.14 
 
 
126 aa  52.4  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  2.52463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  27.63 
 
 
98 aa  50.8  7e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0594  protein of unknown function DUF1232  35.06 
 
 
90 aa  50.4  8e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  32.86 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  26.32 
 
 
98 aa  48.1  3e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  40.35 
 
 
75 aa  48.5  3e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  30.67 
 
 
103 aa  48.5  3e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  45.07 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  48.1  4e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  41.56 
 
 
142 aa  47.8  6e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  31.88 
 
 
97 aa  47.4  8e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  33.77 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  40.26 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  36.71 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  39.47 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  34.29 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.82601e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  45.24 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  35.59 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  40.32 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  35.82 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  40.32 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  40.32 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  31.34 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  40.32 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  35 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  31.43 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  34.55 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  36.84 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  35.53 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.24091e-08  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  34.33 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  40.32 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  45.1 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.99 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  36.99 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  34.67 
 
 
132 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  39.68 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  40.58 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  34.48 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  29.87 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  45.1 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  31.17 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  31.17 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  36.99 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  47.5 
 
 
131 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  33.9 
 
 
135 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>