More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0686 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  52.1 
 
 
142 aa  123  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  44.17 
 
 
118 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  47.22 
 
 
131 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  41.59 
 
 
116 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  43.12 
 
 
114 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  50 
 
 
107 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  43.12 
 
 
114 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  44.17 
 
 
118 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  44.44 
 
 
144 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  45.87 
 
 
125 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  50 
 
 
198 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  44.66 
 
 
144 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  41.24 
 
 
110 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  50 
 
 
198 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  44.04 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  47.42 
 
 
137 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  45.69 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  44.25 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  44.92 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  43.69 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  47.62 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  43.12 
 
 
124 aa  97.1  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  44.95 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  44.04 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  47.96 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  43.27 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  44.23 
 
 
129 aa  96.3  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  45.54 
 
 
114 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  42.98 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  42.45 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  42.11 
 
 
125 aa  95.5  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  45.74 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  43.69 
 
 
119 aa  94.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  42.86 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  40.5 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  43.59 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  47.25 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  44.34 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  47.25 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.5 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  44.64 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  42.73 
 
 
117 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  41.88 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  39.09 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.52 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  45.05 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  44.09 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  40 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  44.86 
 
 
147 aa  92  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  43.12 
 
 
117 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  43.12 
 
 
117 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  41.58 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  40 
 
 
122 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  40.52 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  40 
 
 
122 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  47.37 
 
 
104 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  45.05 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.59 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  47.42 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  43.12 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.86 
 
 
114 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  40 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  45.92 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  40.74 
 
 
123 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  46.55 
 
 
128 aa  90.5  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  49.55 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  42.31 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  45.87 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  39.25 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  37.61 
 
 
114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  37.61 
 
 
114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  37.61 
 
 
114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  44.23 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  46.15 
 
 
121 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  40.38 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  39.64 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  42.34 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  39.18 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  44.68 
 
 
131 aa  88.2  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  47.47 
 
 
113 aa  88.2  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  41.57 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  42.11 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  42.34 
 
 
112 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  39.64 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  38.84 
 
 
137 aa  87.4  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  40.31 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  37.38 
 
 
109 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  44.09 
 
 
123 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  40.66 
 
 
119 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  41.18 
 
 
105 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  40.2 
 
 
226 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  38.32 
 
 
109 aa  87  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  40.95 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0789  Iojap-related protein  37.96 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  43.4 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  40.37 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  43.18 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  40 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>