More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0012 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 
329 aa  654  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  83.28 
 
 
327 aa  516  1e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  82.57 
 
 
327 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  82.24 
 
 
327 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50.17 
 
 
301 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50.88 
 
 
302 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  50.86 
 
 
301 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  50.17 
 
 
301 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  50.17 
 
 
301 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  52.61 
 
 
411 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  52.78 
 
 
301 aa  286  3e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.47156e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  49.83 
 
 
301 aa  285  6e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  51.26 
 
 
301 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  49.83 
 
 
301 aa  284  1e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  49.83 
 
 
301 aa  284  2e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.17 
 
 
301 aa  283  2e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  49.83 
 
 
301 aa  284  2e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  49.12 
 
 
307 aa  283  3e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  49.82 
 
 
301 aa  283  4e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.78733e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  48.68 
 
 
301 aa  282  6e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  48.78 
 
 
301 aa  282  7e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  1.03664e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  51.05 
 
 
301 aa  282  7e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.79629e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  51.62 
 
 
301 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  48 
 
 
301 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  49.47 
 
 
298 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  50.17 
 
 
301 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.25802e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  49.13 
 
 
301 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  49.13 
 
 
301 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  48.84 
 
 
301 aa  278  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  50.54 
 
 
301 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  47.84 
 
 
301 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  2.59145e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  50.52 
 
 
301 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  47.69 
 
 
301 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  47.69 
 
 
301 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  47.85 
 
 
302 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  49.12 
 
 
301 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  50.18 
 
 
301 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.76 
 
 
299 aa  273  2e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.25359e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.76 
 
 
299 aa  273  2e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.23784e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  50.7 
 
 
301 aa  273  2e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.76 
 
 
299 aa  273  2e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.6692e-09  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  49.12 
 
 
299 aa  274  2e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  50.54 
 
 
301 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50.53 
 
 
305 aa  272  5e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  50.18 
 
 
302 aa  272  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  47.04 
 
 
290 aa  272  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50 
 
 
301 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  48.41 
 
 
301 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56532e-09  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  48.41 
 
 
301 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.91941e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  48.41 
 
 
301 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.34298e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  50.53 
 
 
301 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  48.41 
 
 
301 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26065e-07  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  44.95 
 
 
300 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  48.06 
 
 
301 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.19851e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  47.1 
 
 
301 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  47.1 
 
 
301 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.26 
 
 
302 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  47.7 
 
 
301 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  49.12 
 
 
302 aa  266  3e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  5.13891e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  47.35 
 
 
301 aa  266  3e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  49.43 
 
 
286 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  46.76 
 
 
301 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  46.39 
 
 
301 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  47 
 
 
301 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47 
 
 
301 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  47 
 
 
301 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  49.12 
 
 
301 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  45.03 
 
 
300 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  47.69 
 
 
300 aa  262  5e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  46.64 
 
 
301 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.69 
 
 
300 aa  261  9e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  46.15 
 
 
300 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  45.36 
 
 
300 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  46.98 
 
 
303 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.69 
 
 
302 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  45.1 
 
 
300 aa  259  5e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  47.33 
 
 
300 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.33 
 
 
302 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.39 
 
 
301 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  46.62 
 
 
303 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  44.26 
 
 
299 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.04 
 
 
292 aa  254  1e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  42.27 
 
 
310 aa  250  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  46.36 
 
 
305 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  43.42 
 
 
302 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  43.42 
 
 
302 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  42.36 
 
 
456 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  9.8482e-06  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  42.66 
 
 
459 aa  245  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.50409e-07  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  46.42 
 
 
324 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>