More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1046 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  45.16 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  39.36 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  41.67 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 178 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  41.99 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  42.62 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  40.45 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  39.3 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  40.78 
 
 		 175 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  40.78 
 
 		 175 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  42.22 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  38.71 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  39.04 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  40.56 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  37.97 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  38.17 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.11 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  37.77 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  38.67 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40.56 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  41.44 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  39.04 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  37.99 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  39.04 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  38.04 
 
 		 196 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  38.62 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.99 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  37.99 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  38.83 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  39.56 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  38.33 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  39.67 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  40.11 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  39.11 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  39.36 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  38.89 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  39.11 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.33 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  37.57 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  38.46 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  39.56 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  38.59 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  35.71 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  39.34 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  40.11 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  41.49 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  39.23 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  39.66 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  38.8 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  36.96 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  38.8 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  38.55 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  35.91 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  39.67 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  37.99 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  39.44 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  39.78 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  41.49 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  39.01 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  37.1 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  34.81 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  38.67 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  39.78 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  38.12 
 
 		 177 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  36.7 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  37.22 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  38.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>