More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6798 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  65.68 
 
 
764 aa  787  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  63.96 
 
 
760 aa  826  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  65.17 
 
 
777 aa  825  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  54.25 
 
 
739 aa  639  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
739 aa  1424  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  63.24 
 
 
764 aa  796  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  68.62 
 
 
769 aa  870  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  63.84 
 
 
760 aa  848  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  58.89 
 
 
850 aa  792  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  63.65 
 
 
737 aa  804  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  65.58 
 
 
768 aa  808  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  53.64 
 
 
810 aa  675  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  63.4 
 
 
761 aa  869  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  56.15 
 
 
770 aa  654  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  64.95 
 
 
773 aa  808  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  63.84 
 
 
760 aa  848  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  66.85 
 
 
763 aa  804  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  60.65 
 
 
785 aa  761  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  62.55 
 
 
785 aa  742  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  62.5 
 
 
782 aa  808  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  63.65 
 
 
737 aa  804  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  65.33 
 
 
792 aa  851  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  60.28 
 
 
810 aa  753  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  62.37 
 
 
782 aa  808  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  63.56 
 
 
737 aa  759  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  58.68 
 
 
867 aa  792  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  61.61 
 
 
795 aa  786  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  63.65 
 
 
737 aa  804  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  66.09 
 
 
755 aa  884  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  62.23 
 
 
785 aa  801  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  53.86 
 
 
779 aa  691  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  66.4 
 
 
752 aa  805  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  62.84 
 
 
737 aa  749  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  64.97 
 
 
766 aa  890  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  63.06 
 
 
733 aa  837  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  64.27 
 
 
757 aa  874  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  53.02 
 
 
868 aa  644  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  62.25 
 
 
769 aa  824  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  65.14 
 
 
762 aa  801  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  61.38 
 
 
749 aa  796  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  66.89 
 
 
745 aa  843  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  62.5 
 
 
782 aa  808  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  66.4 
 
 
765 aa  851  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  51.45 
 
 
847 aa  646  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  65.71 
 
 
746 aa  870  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  60.7 
 
 
750 aa  791  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  64.75 
 
 
764 aa  771  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  61.93 
 
 
758 aa  771  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  66.98 
 
 
745 aa  863  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  62.23 
 
 
785 aa  802  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  50 
 
 
819 aa  627  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  50.13 
 
 
761 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.6 
 
 
805 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  49 
 
 
754 aa  613  1e-174  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
743 aa  615  1e-174  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
815 aa  613  1e-174  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
802 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
802 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
806 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.33 
 
 
805 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
798 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.33 
 
 
805 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97644e-14 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.47 
 
 
806 aa  598  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  3.37327e-05 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.2 
 
 
805 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.48263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.6 
 
 
806 aa  595  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  50.88 
 
 
751 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.47 
 
 
805 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.81926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.2 
 
 
805 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.2 
 
 
805 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.16421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
821 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.3 
 
 
797 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.96 
 
 
753 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
797 aa  576  1e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  48.92 
 
 
752 aa  574  1e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.13 
 
 
794 aa  573  1e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
803 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
817 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
836 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
786 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  51.85 
 
 
792 aa  562  1e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
889 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.06 
 
 
837 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  43.38 
 
 
799 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
836 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.78 
 
 
752 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  39.28 
 
 
889 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
750 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
838 aa  550  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  47.01 
 
 
804 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
794 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
826 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
837 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
796 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  41.83 
 
 
760 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
793 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
798 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
798 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
866 aa  539  1e-152  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.34074e-09  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.86 
 
 
758 aa  541  1e-152  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
836 aa  540  1e-152  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>