More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6482 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
591 aa  1178    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4344  protein kinase  46.38 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4785  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1065  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
577 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
664 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
646 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
1009 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  38.08 
 
 
1009 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  38.08 
 
 
1017 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
558 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2211  serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 
475 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529503  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1294  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
581 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  37.96 
 
 
993 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  41.67 
 
 
1110 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.49 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
605 aa  153  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
602 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  42.23 
 
 
519 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  40 
 
 
678 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.25 
 
 
676 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 
693 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46 
 
 
419 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 
666 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 
464 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  39.13 
 
 
672 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 
536 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.69 
 
 
650 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.91 
 
 
618 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
618 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  46.63 
 
 
528 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.78 
 
 
594 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.59 
 
 
645 aa  143  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
690 aa  143  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.61 
 
 
700 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  37.85 
 
 
522 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  39.69 
 
 
658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  36.6 
 
 
658 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  36.19 
 
 
668 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.57 
 
 
613 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.4 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
624 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  32.94 
 
 
692 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
624 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
624 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.26 
 
 
621 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 
632 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
598 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
776 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
700 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.33 
 
 
603 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.1 
 
 
1044 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0491  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
568 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0764361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
450 aa  140  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
691 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
662 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
418 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.96 
 
 
681 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.48 
 
 
668 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
615 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.57 
 
 
652 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.39 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  36.23 
 
 
625 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.59 
 
 
627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  36.12 
 
 
625 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  44.39 
 
 
525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  33.83 
 
 
667 aa  137  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
892 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
590 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  38.17 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
502 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
641 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.18 
 
 
627 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  34.98 
 
 
736 aa  137  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 
723 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.5 
 
 
635 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.74 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
673 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.97 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  41.46 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.43 
 
 
613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
776 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
553 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.96 
 
 
681 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  36.6 
 
 
626 aa  135  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.98 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.31 
 
 
601 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  38.85 
 
 
623 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.86 
 
 
642 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  45.32 
 
 
1100 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
453 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
703 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  34.32 
 
 
609 aa  134  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.67 
 
 
661 aa  134  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
863 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.46 
 
 
596 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 
631 aa  133  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  35.56 
 
 
661 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>