45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5158 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1005    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  54.27 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  47.77 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  47.21 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  46.2 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  46.2 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  46 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  47.04 
 
 		 572 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  45.33 
 
 		 591 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  46.65 
 
 		 607 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  44.95 
 
 		 516 aa  350  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  42.38 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  41.52 
 
 		 539 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  33.26 
 
 		 529 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  34.79 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  34.71 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  34.71 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  34.71 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  34.71 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.34 
 
 		 505 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  36.71 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  32.75 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.25 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  30.73 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  31.44 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  36.32 
 
 		 522 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.46 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  31.54 
 
 		 563 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 498 aa  143  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  35.19 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  32.02 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  36.23 
 
 		 472 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  35.52 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  33.02 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  35.17 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  36.09 
 
 		 495 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  31.35 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  28.61 
 
 		 592 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  34.87 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  27.87 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  33.55 
 
 		 632 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  34.9 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  29.93 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  31.03 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  30.26 
 
 		 517 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>