More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0054 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
557 aa  1096  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
703 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
1340 aa  163  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 
1739 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.65 
 
 
860 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
1077 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  36.65 
 
 
700 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
892 aa  142  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
994 aa  137  7e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
1152 aa  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
1106 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
824 aa  134  4e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
902 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
683 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
822 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
294 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.95 
 
 
1837 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
691 aa  115  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
691 aa  115  2e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  33.18 
 
 
336 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.95 
 
 
2401 aa  114  4e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
318 aa  114  4e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
1162 aa  112  2e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.67 
 
 
838 aa  112  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
310 aa  112  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
841 aa  110  8e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1075 aa  110  9e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 
691 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
525 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
358 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
995 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.63 
 
 
338 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
624 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
337 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
836 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
679 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
306 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
1267 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
282 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
346 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.0329e-13 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
313 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
279 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
1267 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
311 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
286 aa  102  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
369 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
328 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
366 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
340 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
401 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
308 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
326 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
334 aa  97.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
307 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
430 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
296 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
415 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
296 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
296 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.68 
 
 
1644 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
785 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
298 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.68 
 
 
1644 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
1435 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
1268 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  32.57 
 
 
323 aa  94.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
331 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
345 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05364e-06 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.65 
 
 
274 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
317 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
307 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.93 
 
 
322 aa  93.6  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
1523 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
582 aa  93.6  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
342 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
293 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.11 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
321 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
340 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.91 
 
 
291 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
753 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
410 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
610 aa  92.8  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
341 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  31.47 
 
 
320 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
616 aa  91.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.16 
 
 
632 aa  91.3  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
411 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
324 aa  91.3  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
324 aa  90.9  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
339 aa  90.9  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
1152 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
306 aa  90.5  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
312 aa  90.1  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
632 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
308 aa  90.1  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
274 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
1523 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
312 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>