28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2850 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  100 
 
 		 101 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  48.39 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  38.61 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  48.39 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  47.25 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  49.44 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  43.75 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  43.14 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  39.8 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  42.57 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  37.21 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  37.21 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  40.4 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  40.4 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  35.85 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  31.31 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  34 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  34 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  37.65 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  34 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>