35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1739 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 293 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  30.94 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  22.15 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  27.85 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  30.49 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0355  hypothetical protein  24.07 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  29.6 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  25.64 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1095  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  23.38 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  28.86 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  19.38 
 
 		 478 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  27.49 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  22.76 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2046  hypothetical protein  23.73 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  27.03 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  28.28 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  28.28 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  20.91 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  22.63 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  23.1 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  26.46 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  22.85 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  21.8 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  21.97 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  27.82 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  23.02 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  22.87 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  22.87 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  22.87 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  24.6 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  21.5 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  24.37 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>