15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0222 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  80.16 
 
 		 365 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  23.97 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  27.89 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  22.45 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  25.57 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  23.38 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  24.92 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  22.33 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2046  hypothetical protein  26.25 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  24.84 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  25.2 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  25.08 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  24.37 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>