More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0179 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  198  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  57.43 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  52.38 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>