More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3140 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  96.27 
 
 
268 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  67.91 
 
 
270 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  67.91 
 
 
270 aa  361  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  67.54 
 
 
270 aa  358  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  67.54 
 
 
270 aa  358  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  68.42 
 
 
254 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  66.67 
 
 
251 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  70.72 
 
 
224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  54.61 
 
 
274 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  55.51 
 
 
273 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  55.51 
 
 
273 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  69.07 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  53.51 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  53.14 
 
 
278 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  49.09 
 
 
293 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  50.74 
 
 
278 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  48.46 
 
 
275 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  45.35 
 
 
276 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  47.83 
 
 
278 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  46.39 
 
 
265 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  45.42 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  45.05 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  45.05 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  45.05 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 
274 aa  218  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  45.42 
 
 
280 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  45.05 
 
 
274 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  45.05 
 
 
274 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  45.05 
 
 
274 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.25 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  54.37 
 
 
235 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  46.01 
 
 
270 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  44.32 
 
 
274 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  44.66 
 
 
295 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  44.66 
 
 
295 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  44.66 
 
 
295 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  41.95 
 
 
298 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  46.3 
 
 
271 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  43.31 
 
 
270 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  42.65 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  45.74 
 
 
275 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  38.87 
 
 
294 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  40.07 
 
 
285 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>