33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1672 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  100 
 
 
323 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  40.62 
 
 
362 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  35.83 
 
 
323 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  35.51 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  32.26 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  32.12 
 
 
228 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.2 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  34.93 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  30.06 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  32.21 
 
 
221 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  31.48 
 
 
219 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  35.09 
 
 
186 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  31.17 
 
 
211 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  31.69 
 
 
225 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  37.78 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  31.13 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  25.89 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  35.9 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  27.27 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  28.17 
 
 
216 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  36.11 
 
 
170 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  34.12 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  34.12 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  28.86 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  37.5 
 
 
200 aa  47  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  37.93 
 
 
182 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  28.39 
 
 
204 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  37.93 
 
 
182 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  28.36 
 
 
198 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  26.95 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  26.95 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  30.91 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  35.21 
 
 
160 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>