More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0210 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
453 aa  894    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  65.76 
 
 
441 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  62.81 
 
 
449 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.43 
 
 
460 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  62.12 
 
 
438 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  61.89 
 
 
434 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  61.43 
 
 
433 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  62.12 
 
 
438 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  62.12 
 
 
434 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  62.12 
 
 
438 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  61.89 
 
 
434 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  58.66 
 
 
442 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.83 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  58.43 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  61.43 
 
 
463 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.5 
 
 
437 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.63 
 
 
439 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  61.29 
 
 
440 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  60.73 
 
 
447 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.16 
 
 
434 aa  507  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  57.83 
 
 
434 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 
438 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  58.06 
 
 
434 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.32 
 
 
435 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.32 
 
 
436 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  61.66 
 
 
452 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.62 
 
 
436 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.06 
 
 
438 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  59.65 
 
 
456 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 
436 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  55.73 
 
 
439 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.76 
 
 
436 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  57.47 
 
 
435 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.14 
 
 
434 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.58 
 
 
438 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.29 
 
 
436 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.63 
 
 
438 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.53 
 
 
433 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.3 
 
 
433 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.86 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.86 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.92 
 
 
451 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.79 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  55.17 
 
 
464 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.25 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.17 
 
 
434 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.55 
 
 
440 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.55 
 
 
440 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.36 
 
 
474 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.8 
 
 
438 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  51.55 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.79 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.69 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  44.78 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.57 
 
 
443 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  44.47 
 
 
440 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.4 
 
 
457 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  45.77 
 
 
522 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.12 
 
 
440 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  45.12 
 
 
440 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  42.51 
 
 
443 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.15 
 
 
442 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 
460 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  44.02 
 
 
448 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45 
 
 
442 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  48.17 
 
 
437 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 
440 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.61 
 
 
445 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  44.24 
 
 
443 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  41.5 
 
 
440 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  45.35 
 
 
440 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  43.35 
 
 
437 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  43.35 
 
 
437 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  47.94 
 
 
437 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.28 
 
 
450 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 
435 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  47.74 
 
 
446 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  44.12 
 
 
454 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.89 
 
 
457 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  44.37 
 
 
447 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  43.9 
 
 
466 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.95 
 
 
444 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  42.76 
 
 
445 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  46.15 
 
 
446 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.29 
 
 
446 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  43.9 
 
 
454 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.82 
 
 
445 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  44.14 
 
 
438 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  42.53 
 
 
450 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.75 
 
 
445 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  43.96 
 
 
442 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  41.95 
 
 
445 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.83 
 
 
438 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  42.53 
 
 
450 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.43 
 
 
453 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.35 
 
 
457 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  42.86 
 
 
438 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.09 
 
 
448 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>