More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4522 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
753 aa  1541    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 
829 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.14 
 
 
767 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.69 
 
 
772 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.27 
 
 
772 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.94 
 
 
778 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.32 
 
 
714 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.69 
 
 
765 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 
717 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.67 
 
 
683 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 
779 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.21 
 
 
700 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.57 
 
 
772 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.14 
 
 
904 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 
815 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.96 
 
 
685 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.19 
 
 
712 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 
685 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.89 
 
 
689 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 
817 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 
818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 
904 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 
908 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 
819 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 
862 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.57 
 
 
846 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.84 
 
 
846 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 
681 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 
819 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.6 
 
 
707 aa  512  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 
706 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.36 
 
 
702 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 
827 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 
827 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.73 
 
 
832 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 
696 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 
776 aa  505  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.36 
 
 
706 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 
822 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.94 
 
 
679 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.42 
 
 
695 aa  497  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 
686 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 
694 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.02 
 
 
692 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.84 
 
 
740 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 
846 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.95 
 
 
842 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 
822 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 
812 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 
680 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 
763 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  40.25 
 
 
818 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 
786 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.41 
 
 
779 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.25 
 
 
818 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 
706 aa  491  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 
686 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.25 
 
 
842 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 
681 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.89 
 
 
818 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.33 
 
 
703 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 
691 aa  485  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.9 
 
 
701 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 
773 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
704 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.58 
 
 
704 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
704 aa  482  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 
903 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 
859 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  39.29 
 
 
700 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
805 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 
696 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
682 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
702 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.53 
 
 
799 aa  479  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 
693 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 
815 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.04 
 
 
902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 
728 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.04 
 
 
866 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.04 
 
 
902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.04 
 
 
902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 
692 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 
693 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 
696 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 
682 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.04 
 
 
902 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 
818 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 
693 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.64 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.18 
 
 
686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 
683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.29 
 
 
703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 
695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 
719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 
690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 
696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
679 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 
696 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 
678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>