27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0132 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1710    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  40 
 
 		 4009 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  51.52 
 
 		 14609 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  45.57 
 
 		 1188 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  38.95 
 
 		 4022 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  51.52 
 
 		 3027 aa  61.6  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  35.63 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1316 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  45.57 
 
 		 1831 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  46.67 
 
 		 3907 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  39.29 
 
 		 767 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  38.24 
 
 		 4357 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  41.57 
 
 		 1394 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  46.03 
 
 		 3861 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  44.44 
 
 		 3822 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  43.06 
 
 		 866 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  37.89 
 
 		 476 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1908 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  51.16 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  46.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3363  hypothetical protein  38.55 
 
 		 326 aa  48.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  58.54 
 
 		 1487 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.65 
 
 		 2031 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 462 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0004  triacylglycerol lipase  34.15 
 
 		 392 aa  44.3  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000112328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>