More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1783 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  99.74 
 
 
399 aa  766  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  100 
 
 
383 aa  768  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  58.76 
 
 
376 aa  417  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  58.76 
 
 
376 aa  417  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  53.54 
 
 
372 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  53.54 
 
 
390 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  53.11 
 
 
376 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  54.67 
 
 
372 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  54.93 
 
 
374 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  53.25 
 
 
372 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  52.52 
 
 
372 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  52.52 
 
 
372 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  51.99 
 
 
368 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  51.17 
 
 
374 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  53.1 
 
 
372 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  52.79 
 
 
378 aa  362  7e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  52.29 
 
 
379 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  54.4 
 
 
375 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  53.12 
 
 
373 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  48.57 
 
 
376 aa  358  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  1.1704e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  50.4 
 
 
378 aa  357  3e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  55.95 
 
 
378 aa  356  3e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  53.23 
 
 
372 aa  357  3e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  51.2 
 
 
371 aa  356  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  53.05 
 
 
372 aa  355  6e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  53.05 
 
 
372 aa  355  6e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  53.05 
 
 
372 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  50.92 
 
 
373 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  53.23 
 
 
372 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  50.8 
 
 
378 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  353  3e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  53.05 
 
 
372 aa  353  3e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  50.13 
 
 
382 aa  353  3e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
372 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  352  9e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  352  9e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  51.72 
 
 
372 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  52.03 
 
 
376 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  52.8 
 
 
374 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  1.38199e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  53.19 
 
 
380 aa  349  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  52.56 
 
 
372 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
394 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  51.47 
 
 
372 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  51.97 
 
 
372 aa  345  9e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  50.53 
 
 
375 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  52.02 
 
 
372 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  50.91 
 
 
380 aa  342  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  51.47 
 
 
372 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  50.65 
 
 
380 aa  338  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  51.83 
 
 
374 aa  337  3e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  51.72 
 
 
374 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  51.2 
 
 
372 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  50.92 
 
 
380 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  51.31 
 
 
374 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  51.55 
 
 
379 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  53.91 
 
 
374 aa  320  2e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.31 
 
 
373 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.08 
 
 
373 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.04023e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 
374 aa  285  1e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
405 aa  285  1e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.73 
 
 
378 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  40.31 
 
 
373 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  44.68 
 
 
390 aa  275  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
370 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
376 aa  275  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  44.15 
 
 
390 aa  274  2e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.32 
 
 
376 aa  274  2e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 
390 aa  272  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.35095e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
367 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  43.85 
 
 
393 aa  269  6e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 
367 aa  269  6e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.71 
 
 
373 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.19132e-06  unclonable  1.82515e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.26557e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  42.09 
 
 
369 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  53.85 
 
 
260 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
373 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.15273e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>