More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0054 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  99.54 
 
 
218 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  100 
 
 
216 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.74 
 
 
207 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.57 
 
 
206 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.57 
 
 
206 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.03 
 
 
206 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  4.92857e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.24 
 
 
207 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  47.03 
 
 
206 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.53 
 
 
206 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.53 
 
 
206 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.09 
 
 
206 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.04 
 
 
206 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  47.24 
 
 
207 aa  183  1e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.03 
 
 
206 aa  181  5e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.03 
 
 
207 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.15 
 
 
206 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.78 
 
 
207 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  44.33 
 
 
206 aa  172  3e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.15 
 
 
210 aa  162  4e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  45.1 
 
 
239 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  40.19 
 
 
215 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44 
 
 
206 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  40.58 
 
 
212 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.49619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.61 
 
 
210 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.19 
 
 
211 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  37.91 
 
 
212 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  38.94 
 
 
214 aa  152  3e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  38.83 
 
 
207 aa  152  3e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.43138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  39.61 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  38.94 
 
 
214 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  39.61 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  39.61 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  39.61 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  39.61 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.66 
 
 
213 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.9 
 
 
202 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  38.94 
 
 
214 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  38.94 
 
 
214 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  38.35 
 
 
207 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  38.03 
 
 
213 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  1.97593e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.17 
 
 
212 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.17 
 
 
212 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  37.98 
 
 
214 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  1.52892e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.2238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  37.25 
 
 
208 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  39.71 
 
 
210 aa  144  7e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  39.71 
 
 
210 aa  144  7e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  39.71 
 
 
210 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  40.19 
 
 
210 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  39.05 
 
 
210 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  40.19 
 
 
210 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  40.19 
 
 
210 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  40.19 
 
 
210 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.46 
 
 
216 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  38.57 
 
 
210 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  139  4e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  8.38099e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2999  integral membrane protein, MarC family  42.16 
 
 
210 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.04 
 
 
217 aa  136  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2609  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.16 
 
 
224 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.46 
 
 
215 aa  134  1e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.73 
 
 
214 aa  133  2e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.86 
 
 
217 aa  131  1e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.16 
 
 
217 aa  130  2e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.14 
 
 
217 aa  128  5e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.15 
 
 
215 aa  128  7e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.82 
 
 
231 aa  128  8e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.07 
 
 
231 aa  127  1e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.1 
 
 
213 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.04 
 
 
212 aa  125  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 
212 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35 
 
 
219 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 
235 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.31 
 
 
207 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.29 
 
 
219 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.71 
 
 
219 aa  120  2e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  37.85 
 
 
216 aa  120  2e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.31 
 
 
214 aa  119  4e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.82 
 
 
206 aa  118  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.02 
 
 
210 aa  118  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.93827e-09  hitchhiker  6.82503e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.65 
 
 
213 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>