673 genes were found for organism Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mpe_B0001  CDS  NC_008826  20  1363  +  1344  hypothetical protein  YP_001023017  normal  1  normal  0.0762819  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0002  CDS  NC_008826  1424  2983  +  1560  hypothetical protein  YP_001023018  normal  1  normal  0.117101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0003  CDS  NC_008826  3019  3972  +  954  hypothetical protein  YP_001023019  normal  1  normal  0.093231  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0004  CDS  NC_008826  3981  4856  -  876  ISMca2 transposase OrfB  YP_001023020  normal  1  normal  0.0575577  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0005  CDS  NC_008826  4853  5173  -  321  ISMca2 transposase OrfA  YP_001023021  normal  1  normal  0.0472147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0006  CDS  NC_008826  5244  5732  +  489  hypothetical protein  YP_001023022  normal  1  normal  0.0288045  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0007  CDS  NC_008826  5765  6151  +  387  hypothetical protein  YP_001023023  normal  0.790576  normal  0.0154914  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0008  CDS  NC_008826  6154  6714  +  561  hypothetical protein  YP_001023024  normal  0.787155  normal  0.0163162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0009  CDS  NC_008826  6932  7402  +  471  hypothetical protein  YP_001023025  normal  1  normal  0.0161658  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0010  CDS  NC_008826  7520  7810  +  291  hypothetical protein  YP_001023026  normal  1  normal  0.0150538  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0011  CDS  NC_008826  7816  10410  +  2595  ATP-dependent DNA ligase  YP_001023027  normal  1  normal  0.0339968  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0012  CDS  NC_008826  10558  10938  +  381  hypothetical protein  YP_001023028  normal  1  hitchhiker  0.00816784  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0013  CDS  NC_008826  10960  11508  +  549  hypothetical protein  YP_001023029  normal  1  hitchhiker  0.00858185  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0014  CDS  NC_008826  11526  11951  +  426  hypothetical protein  YP_001023030  normal  1  hitchhiker  0.00871354  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0015  CDS  NC_008826  12025  12879  -  855  hypothetical protein  YP_001023031  normal  1  normal  0.0114372  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0016  CDS  NC_008826  13393  15450  +  2058  endothelin-converting protein 1  YP_001023032  normal  1  hitchhiker  0.00932901  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0017  CDS  NC_008826  15722  16153  +  432  hypothetical protein  YP_001023033  normal  1  hitchhiker  0.00491094  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0018  CDS  NC_008826  16200  17096  -  897  hypothetical protein  YP_001023034  normal  0.992916  hitchhiker  0.000537974  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0019  CDS  NC_008826  17247  18338  +  1092  hypothetical protein  YP_001023035  normal  0.891447  hitchhiker  0.00148925  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0020  CDS  NC_008826  18416  20344  +  1929  hypothetical protein  YP_001023036  normal  1  hitchhiker  0.00459602  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0021  CDS  NC_008826  20445  21083  +  639  hypothetical protein  YP_001023037  normal  0.907195  hitchhiker  0.00306993  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0022  CDS  NC_008826  21111  21380  +  270  hypothetical protein  YP_001023038  normal  1  hitchhiker  0.00261466  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0023  CDS  NC_008826  21385  21669  -  285  hypothetical protein  YP_001023039  normal  0.955132  hitchhiker  0.00548085  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0024  CDS  NC_008826  21736  22503  +  768  Sir2 family transcriptional regulator  YP_001023040  normal  1  hitchhiker  0.00361903  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0025  CDS  NC_008826  22688  23251  +  564  hypothetical protein  YP_001023041  normal  1  hitchhiker  0.00367836  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0026  CDS  NC_008826  23248  23967  +  720  hypothetical protein  YP_001023042  normal  0.371687  hitchhiker  0.00178086  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0027  CDS  NC_008826  24001  24441  +  441  hypothetical protein  YP_001023043  normal  0.427776  hitchhiker  0.00681034  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0028  CDS  NC_008826  24610  25236  -  627  hypothetical protein  YP_001023044  normal  1  hitchhiker  0.00348193  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0029  CDS  NC_008826  25374  26783  +  1410  AAA+ class-like ATPase  YP_001023045  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0030  CDS  NC_008826  26858  27400  -  543  hypothetical protein  YP_001023046  normal  1  hitchhiker  0.0060437  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0031  CDS  NC_008826  27654  27932  -  279  hypothetical protein  YP_001023047  normal  1  hitchhiker  0.00568245  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0032  CDS  NC_008826  28093  28362  +  270  hypothetical protein  YP_001023048  normal  1  hitchhiker  0.000182917  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0033  CDS  NC_008826  28381  29043  +  663  hypothetical protein  YP_001023049  normal  1  hitchhiker  0.0000766815  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0034  CDS  NC_008826  29007  29561  +  555  hypothetical protein  YP_001023050  normal  1  hitchhiker  0.0000682108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0035  CDS  NC_008826  29841  30344  +  504  hypothetical protein  YP_001023051  normal  0.674162  hitchhiker  0.000199345  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0036  CDS  NC_008826  30359  30970  +  612  hypothetical protein  YP_001023052  normal  0.590816  hitchhiker  0.000194177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0037  CDS  NC_008826  31049  31564  +  516  hypothetical protein  YP_001023053  normal  0.24566  hitchhiker  0.0000607105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0038  CDS  NC_008826  31536  32432  -  897  hypothetical protein  YP_001023054  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0039  CDS  NC_008826  32695  32934  +  240  hypothetical protein  YP_001023055  normal  0.843955  hitchhiker  0.0000503982  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0040  CDS  NC_008826  33459  33947  -  489  hypothetical protein  YP_001023056  normal  1  decreased coverage  0.0000158895  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0041    NC_008826  34012  34458  -  447      normal  1  decreased coverage  0.0000154317  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0042  CDS  NC_008826  34588  35010  -  423  hypothetical protein  YP_001023057  normal  1  hitchhiker  0.0000511163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0043  CDS  NC_008826  35521  36051  -  531  hypothetical protein  YP_001023058  normal  1  hitchhiker  0.0000586476  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0044  CDS  NC_008826  36240  37073  -  834  hypothetical protein  YP_001023059  normal  1  hitchhiker  0.00020597  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0045  CDS  NC_008826  37268  37825  -  558  hypothetical protein  YP_001023060  normal  1  hitchhiker  0.00046402  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0046    NC_008826  38885  39433  -  549      normal  1  hitchhiker  0.00117933  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0047  CDS  NC_008826  39540  39746  -  207  hypothetical protein  YP_001023061  normal  1  hitchhiker  0.000988351  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0048  CDS  NC_008826  39879  40292  +  414  DNA polymerase V  YP_001023062  normal  1  hitchhiker  0.00109264  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0049  CDS  NC_008826  40374  41579  +  1206  hypothetical protein  YP_001023063  normal  0.722506  hitchhiker  0.00143766  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0050  CDS  NC_008826  41567  41896  +  330  hypothetical protein  YP_001023064  normal  1  hitchhiker  0.00096516  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0051  CDS  NC_008826  41906  42205  -  300  hypothetical protein  YP_001023065  normal  0.93512  hitchhiker  0.000920757  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0052  CDS  NC_008826  42320  43669  +  1350  DNA-directed DNA polymerase  YP_001023066  normal  1  hitchhiker  0.00154189  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0053  CDS  NC_008826  43753  44529  -  777  hypothetical protein  YP_001023067  normal  1  hitchhiker  0.00273395  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0054  CDS  NC_008826  44740  45480  +  741  hypothetical protein  YP_001023068  normal  1  hitchhiker  0.0051765  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0055  CDS  NC_008826  45527  45853  -  327  hypothetical protein  YP_001023069  normal  1  hitchhiker  0.0042809  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0056  CDS  NC_008826  45850  46554  -  705  hypothetical protein  YP_001023070  normal  1  hitchhiker  0.00488464  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0057  CDS  NC_008826  46539  49397  -  2859  hypothetical protein  YP_001023071  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0058  CDS  NC_008826  49436  49993  -  558  hypothetical protein  YP_001023072  normal  1  hitchhiker  0.00432848  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0059  CDS  NC_008826  50091  51197  -  1107  hypothetical protein  YP_001023073  normal  1  hitchhiker  0.00525778  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0060  CDS  NC_008826  51199  51762  -  564  hypothetical protein  YP_001023074  normal  1  hitchhiker  0.00816784  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0061  CDS  NC_008826  51767  52657  -  891  hypothetical protein  YP_001023075  normal  1  normal  0.0106296  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0062  CDS  NC_008826  52662  53156  -  495  hypothetical protein  YP_001023076  normal  1  normal  0.0167835  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0063  CDS  NC_008826  53436  54005  +  570  hypothetical protein  YP_001023077  normal  0.482033  hitchhiker  0.00911792  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0064  CDS  NC_008826  54291  55664  +  1374  hypothetical protein  YP_001023078  normal  1  hitchhiker  0.00583147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0065  CDS  NC_008826  55682  56314  +  633  hypothetical protein  YP_001023079  normal  1  hitchhiker  0.00412554  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0066  CDS  NC_008826  56370  57209  +  840  ParB, partition protein  YP_001023080  normal  1  hitchhiker  0.002131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0067  CDS  NC_008826  57517  57909  -  393  hypothetical protein  YP_001023081  normal  1  hitchhiker  0.00184087  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0068  CDS  NC_008826  57934  58383  -  450  hypothetical protein  YP_001023082  normal  1  hitchhiker  0.00184087  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0069  CDS  NC_008826  58486  61326  -  2841  TnpA family transposase  YP_001023083  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0070  CDS  NC_008826  61332  62207  -  876  ISMca2 transposase OrfB  YP_001023084  normal  1  hitchhiker  0.0088066  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0071  CDS  NC_008826  62204  62524  -  321  ISMca2 transposase OrfA  YP_001023085  normal  1  hitchhiker  0.00694187  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0072  CDS  NC_008826  63062  64645  +  1584  putative sensor/response hybrid  YP_001023086  normal  1  normal  0.0111636  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0073  CDS  NC_008826  64810  65112  +  303  hypothetical protein  YP_001023087  normal  1  hitchhiker  0.00676847  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0074  CDS  NC_008826  65552  65782  +  231  hypothetical protein  YP_001023088  normal  0.797701  hitchhiker  0.00319185  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0075  CDS  NC_008826  65797  66459  +  663  hypothetical protein  YP_001023089  normal  1  hitchhiker  0.00393438  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0076  CDS  NC_008826  66565  68958  +  2394  hypothetical protein  YP_001023090  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0077  CDS  NC_008826  69149  70156  -  1008  ParB family protein  YP_001023091  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0078  CDS  NC_008826  70153  71346  -  1194  partitioning protein, ParA  YP_001023092  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0079  CDS  NC_008826  71551  72171  +  621  hypothetical protein  YP_001023093  normal  1  hitchhiker  0.00159937  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0080  CDS  NC_008826  72129  73496  +  1368  hypothetical protein  YP_001023094  normal  1  hitchhiker  0.00491094  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0081  CDS  NC_008826  73667  74083  +  417  hypothetical protein  YP_001023095  normal  1  hitchhiker  0.00382973  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0082  CDS  NC_008826  74117  74425  -  309  hypothetical protein  YP_001023096  normal  1  hitchhiker  0.00161766  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0083  CDS  NC_008826  74976  76298  +  1323  hypothetical protein  YP_001023097  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0084  CDS  NC_008826  76303  77568  -  1266  hypothetical protein  YP_001023098  normal  0.756678  hitchhiker  0.00284164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0085  CDS  NC_008826  77631  77798  +  168  hypothetical protein  YP_001023099  normal  0.444608  hitchhiker  0.00164565  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0086  CDS  NC_008826  77844  78608  -  765  hypothetical protein  YP_001023100  normal  0.485417  hitchhiker  0.000988351  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0087  CDS  NC_008826  78616  79443  -  828  hypothetical protein  YP_001023101  normal  1  hitchhiker  0.000976689  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0088  CDS  NC_008826  79497  80201  +  705  hypothetical protein  YP_001023102  normal  1  hitchhiker  0.000366157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0089  CDS  NC_008826  80286  80747  +  462  hypothetical protein  YP_001023103  normal  1  hitchhiker  0.000341987  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0090  CDS  NC_008826  80750  81295  +  546  hypothetical protein  YP_001023104  normal  1  hitchhiker  0.000384961  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0091  CDS  NC_008826  81434  81733  -  300  hypothetical protein  YP_001023105  normal  1  hitchhiker  0.000315207  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0092  CDS  NC_008826  81737  81982  +  246  hypothetical protein  YP_001023106  normal  1  hitchhiker  0.000290395  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0093  CDS  NC_008826  82217  82507  +  291  hypothetical protein  YP_001023107  normal  1  hitchhiker  0.000333539  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0094  CDS  NC_008826  82580  82876  +  297  hypothetical protein  YP_001023108  normal  1  hitchhiker  0.000327316  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0095  CDS  NC_008826  82915  84105  +  1191  hypothetical protein  YP_001023109  normal  1  hitchhiker  0.000192884  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0096  CDS  NC_008826  84218  84877  -  660  hypothetical protein  YP_001023110  normal  1  hitchhiker  0.000132538  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0097  CDS  NC_008826  85020  85811  +  792  hypothetical protein  YP_001023111  normal  1  hitchhiker  0.000141563  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0098  CDS  NC_008826  85954  87321  +  1368  hypothetical protein  YP_001023112  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0099  CDS  NC_008826  87437  88513  -  1077  hypothetical protein  YP_001023113  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_B0100  CDS  NC_008826  88565  88828  -  264  hypothetical protein  YP_001023114  normal  0.427249  hitchhiker  0.000114701  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>