34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0099 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  736    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  33.9 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  31 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  30.94 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  31.43 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2295  hypothetical protein  33.94 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441096  hitchhiker  0.0000000276618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0954368  normal  0.878787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  35.42 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  28.78 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1111  hypothetical protein  27.23 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00120065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0305  hypothetical protein  27.23 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00109912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  32.8 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  27.13 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3823  phage-type endonuclease  32.69 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  32.07 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2345  hypothetical protein  32.45 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0556  hypothetical protein  24.07 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  28.41 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  31.55 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  33.15 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  35.42 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  32.35 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1078  hypothetical protein  27.46 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000782333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  32.41 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  28.12 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  26.85 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0783  exonuclease  31.45 
 
 		 202 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  33.1 
 
 		 334 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1818  hypothetical protein  31.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.11 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2141  hypothetical protein  30.43 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.197633  normal  0.240779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1915  exonuclease, phage-type  33.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4749  hitchhiker  0.000000000427388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>