30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0110 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  100 
 
 
336 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  41.47 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  28.76 
 
 
304 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  31 
 
 
358 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  27.1 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  28.85 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  28.85 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  28.19 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  25.41 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  26.12 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  27.05 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  25.74 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  28.71 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0305  hypothetical protein  27.67 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00109912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1111  hypothetical protein  27.67 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00120065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  24.18 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0556  hypothetical protein  25.85 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  27.36 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  26.8 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  23.62 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  26.48 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  24.23 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  24.38 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  24.92 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  25.48 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  25.68 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1078  hypothetical protein  28.95 
 
 
550 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000782333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2821  hypothetical protein  31.85 
 
 
553 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0954368  normal  0.878787 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P38  BppA  28.1 
 
 
441 aa  42.7  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00296198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>