35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0110 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  83.33 
 
 
331 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  76.36 
 
 
331 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  83.28 
 
 
300 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  67.6 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  63.04 
 
 
334 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  60.66 
 
 
334 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  61.56 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  58.97 
 
 
342 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  51.56 
 
 
374 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  51.56 
 
 
374 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  51.41 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.87 
 
 
306 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  37.27 
 
 
311 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  86.79 
 
 
136 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  33.96 
 
 
311 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  42.66 
 
 
310 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  35.57 
 
 
303 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  45.6 
 
 
247 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  32.5 
 
 
338 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  33.23 
 
 
338 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  31.61 
 
 
322 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  36.65 
 
 
303 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  32.07 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  28.28 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  27.65 
 
 
304 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  24.23 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  27.43 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  25.98 
 
 
316 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  21.86 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  27.8 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  26.94 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  27.19 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6183  predicted protein  28.74 
 
 
189 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6182  predicted protein  28.74 
 
 
189 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>