20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4009 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  36.65 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  36.42 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  24.69 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  28.73 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  25.1 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  27.02 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  26.67 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  27.78 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  27.23 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  26.39 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  26.92 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  27.23 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  23.91 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  27.48 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  25.25 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  25.11 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  25.25 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  25.46 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  27.6 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>