30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2619 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  100 
 
 
311 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  58.2 
 
 
311 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  48.85 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  45.95 
 
 
303 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  43.26 
 
 
310 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  38.86 
 
 
338 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  39.32 
 
 
374 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  35.44 
 
 
331 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  39.63 
 
 
334 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  38.39 
 
 
374 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  39.38 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  34.92 
 
 
331 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  35.65 
 
 
338 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  37.11 
 
 
342 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  39.51 
 
 
334 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  37.54 
 
 
368 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  37.3 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  33.96 
 
 
358 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  34.56 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  40.38 
 
 
303 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  32.28 
 
 
322 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  33.33 
 
 
247 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  36.84 
 
 
136 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  28.16 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  28.41 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  26.8 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  25.33 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  24.48 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  28.19 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  23.33 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>