22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6976 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  90.19 
 
 		 316 aa  547  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  89.56 
 
 		 316 aa  534  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  91.77 
 
 		 316 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  30.94 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  29.51 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  30.1 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  26.85 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  24.23 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  26.9 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  26.69 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  27.8 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  24.51 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  22.53 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  23.1 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  20.95 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  25.57 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  25.24 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  25.26 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  24.4 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>