26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4502 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1097    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  54.43 
 
 
543 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  44.29 
 
 
543 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  54.43 
 
 
543 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  51.34 
 
 
517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  52.24 
 
 
517 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  41.02 
 
 
530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  40.15 
 
 
521 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  38.86 
 
 
519 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  38.86 
 
 
519 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  35.12 
 
 
582 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  34.18 
 
 
584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  35.96 
 
 
523 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  35.47 
 
 
533 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  35.01 
 
 
538 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  31.46 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  28.85 
 
 
523 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  31.85 
 
 
511 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  32.01 
 
 
552 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  31.45 
 
 
537 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  27.1 
 
 
523 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  25.91 
 
 
496 aa  97.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  27.76 
 
 
510 aa  96.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  27.41 
 
 
524 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.64 
 
 
456 aa  53.9  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  22.42 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>