25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0729 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  100 
 
 		 552 aa  1102    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  39.84 
 
 		 538 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  39.63 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  40.12 
 
 		 523 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  39.1 
 
 		 533 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  38.18 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  30.94 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  30.04 
 
 		 530 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  35.45 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  31.63 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  31.62 
 
 		 517 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  30.42 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  29.79 
 
 		 521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  27.68 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  27.68 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  32.58 
 
 		 544 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  27.95 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  29.92 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  28.8 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  28.8 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  27.52 
 
 		 537 aa  107  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  26.75 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  24.63 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.09 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  24.55 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>