26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0667 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1100    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  90.52 
 
 		 538 aa  1009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  89.68 
 
 		 528 aa  971    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  44.38 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  38.53 
 
 		 584 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  39.1 
 
 		 552 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  30.83 
 
 		 517 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  32.75 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  30.52 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  32.53 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  32.53 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  35.47 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  31.99 
 
 		 511 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  29.32 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  29.37 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  29.37 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  30.12 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  27.59 
 
 		 521 aa  170  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  25.68 
 
 		 510 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  29.72 
 
 		 537 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  29.59 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  26.08 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  24.27 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  22.15 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  23.08 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>