28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3783 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1104    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  33.05 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  30.46 
 
 		 582 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  30.45 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  33.1 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  31.45 
 
 		 544 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  29.97 
 
 		 530 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  28.12 
 
 		 584 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  32.79 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  29.38 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  29.38 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  29.7 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  27.8 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  26.56 
 
 		 523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  28.48 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  27.43 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  29.17 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  26.49 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  26.49 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  29.37 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  28.65 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  29.72 
 
 		 533 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  27.95 
 
 		 543 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  27.94 
 
 		 456 aa  93.6  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  25.34 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  20.34 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  25.76 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  23.17 
 
 		 545 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>