27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0433 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  100 
 
 
510 aa  1051    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  32.87 
 
 
496 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  33.05 
 
 
537 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  33.14 
 
 
524 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  31.36 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  25.68 
 
 
533 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  26.17 
 
 
528 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  25.99 
 
 
538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  26.48 
 
 
523 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  27.83 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  26.36 
 
 
584 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  22.93 
 
 
582 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  27.73 
 
 
544 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  26.01 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  28.21 
 
 
517 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  22.74 
 
 
543 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  22.74 
 
 
543 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  24.93 
 
 
511 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  22.87 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  25.97 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  23.9 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  22.9 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  22.42 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  22.42 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.26 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  24.26 
 
 
505 aa  63.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  22.12 
 
 
545 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>