28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1877 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1191    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  37.9 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  33.84 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  37.56 
 
 		 543 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  37.56 
 
 		 543 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  32.88 
 
 		 584 aa  250  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  30.94 
 
 		 517 aa  246  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  37.68 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  37.72 
 
 		 523 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  29.17 
 
 		 538 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  38.63 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  33.02 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  29.5 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  32.63 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  35.26 
 
 		 530 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  31.86 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  31.29 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  31.29 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  35.55 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  30.46 
 
 		 537 aa  170  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.93 
 
 		 510 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  26.65 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  23.97 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  26.5 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  22.99 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  25.94 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  22.5 
 
 		 505 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  21.4 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>