28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0671 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  100 
 
 		 530 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  39.07 
 
 		 519 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  39.07 
 
 		 519 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  34.45 
 
 		 521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  36.19 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  35.66 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  40.84 
 
 		 543 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  40.84 
 
 		 543 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  41.02 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  33.68 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  33.08 
 
 		 584 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  35.43 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  33.25 
 
 		 523 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  30.24 
 
 		 538 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  29.08 
 
 		 533 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  29.49 
 
 		 528 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  31.46 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  30.45 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  30.63 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  29.97 
 
 		 537 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.73 
 
 		 510 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.69 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  23.1 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  25 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  21.92 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  24.52 
 
 		 505 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  21.33 
 
 		 545 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  25.15 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>