26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1299 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  54.14 
 
 		 543 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  53.81 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  54.43 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  46.79 
 
 		 517 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  42.37 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  42.37 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  40.24 
 
 		 521 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  40.84 
 
 		 530 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  33.22 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  33.27 
 
 		 523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  32.64 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  30.25 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  30.98 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  29.66 
 
 		 528 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  30 
 
 		 538 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  28.74 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  28.48 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  27.82 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  26.4 
 
 		 524 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.74 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  24.95 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  26.43 
 
 		 523 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  23.08 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  21.83 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>