26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2932 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1008    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  33.2 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  33.46 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  30.83 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  28.57 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  25.91 
 
 		 544 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  26.08 
 
 		 533 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  26.59 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  24.19 
 
 		 505 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.34 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  23.53 
 
 		 519 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  23.53 
 
 		 519 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  27.24 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  24.84 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  25.17 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  25.16 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  30.21 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  23.97 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  26.98 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  23.1 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  26 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  25.18 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  25 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  26.57 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  26.57 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  25.3 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>