28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0763 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1059    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  77.73 
 
 		 521 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1059    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  39.07 
 
 		 530 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  42.37 
 
 		 543 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  42.37 
 
 		 543 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  38.49 
 
 		 517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  40.27 
 
 		 517 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  36.38 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  38.83 
 
 		 544 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  31.29 
 
 		 582 aa  223  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  29.02 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  29.37 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  28.81 
 
 		 523 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  29.3 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  29.35 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  28.06 
 
 		 523 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  27.87 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  29.38 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  31.39 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  25.45 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  26.8 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.78 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  27.71 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  26.64 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  26 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>