28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2680 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  77.73 
 
 		 519 aa  815    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1063    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  77.73 
 
 		 519 aa  815    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  34.45 
 
 		 530 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  41.18 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  41.18 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  37.5 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  38.81 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  40.15 
 
 		 544 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  38.08 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  31.86 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  29.1 
 
 		 584 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  27.73 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  27.59 
 
 		 533 aa  170  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  28.54 
 
 		 538 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  28.47 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  27.03 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  28.87 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  27.58 
 
 		 523 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  32.79 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  25.17 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.9 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  27.59 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  29.7 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  30.28 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  27.87 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  24.07 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  28.93 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>