70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2140 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2140  AzlC family protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.26 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  25.66 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.31 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  25.44 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  29.41 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  28.76 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  28.76 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  26.04 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  28.65 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  26.04 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  28.1 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.61 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  29.03 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  28.48 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  27.06 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  26.62 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.78 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  28.98 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  30 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  26.42 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  26.54 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  26.58 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  26.58 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  30.77 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  29.33 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  30.82 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  30.43 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  27.41 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  24.39 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.81 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  29.03 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  26.04 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  27.95 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  25.17 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.19 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  28.72 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  26.11 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  28.9 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  24 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  28.25 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.66 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  26.8 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  27.47 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.16 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  26.29 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  29.38 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  27.33 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  27.33 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  26.39 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  23.43 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  25.71 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  25.62 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  26.43 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  23.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  25.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  26.22 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  25.78 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  26.83 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  23.43 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  22.86 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  28.18 
 
 		 238 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>