143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3657 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  100 
 
 		 94 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  76.92 
 
 		 93 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  78.02 
 
 		 93 aa  153  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  73.12 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  70.65 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  61.54 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  61.96 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  59.78 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  61.54 
 
 		 93 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  63.74 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  63.33 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  58.24 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  56.04 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  57.78 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  56.67 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  53.26 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  55.43 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  54.44 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  53.26 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  53.76 
 
 		 93 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  53.85 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  52.75 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  55.43 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  52.13 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  51.65 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  48.91 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  56.67 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  50.56 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  51.69 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  51.69 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  51.09 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  45.98 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  48.15 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  47.37 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  37.36 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  43.08 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  34.09 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  34.41 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  38.2 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  40.22 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  35.56 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  34.44 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  34.07 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  34.41 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  37.76 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  37.76 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  37.88 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  35.63 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  32.22 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  34.34 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  29.67 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  35.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  31.87 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  35.23 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  35.23 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  30.11 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  36.92 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  43.06 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  28.57 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  29.03 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  40.66 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  34.88 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  27.96 
 
 		 274 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  31.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  32.95 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  31.11 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  31.4 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  32.26 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  30.11 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  34.85 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  32.97 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  27.96 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0840  hypothetical protein  29.21 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  31.18 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  29.03 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  29.55 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>