147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3377 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  63.51 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  59.46 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  58.11 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  55.41 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  54.05 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  55.41 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  58.11 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  55.41 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  56.16 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  56.76 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  52.7 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  51.35 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  55.41 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  52.7 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  55.41 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  54.05 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  55.41 
 
 		 94 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  51.35 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  54.05 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  48.65 
 
 		 93 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  55.41 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  52.7 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  48.65 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  47.3 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  48.65 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  47.3 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  48.65 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  48.65 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  52.63 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  48.65 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  44.59 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  48 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.733317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  46.48 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  49.23 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  42.47 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  46.97 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  49.23 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  47.69 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  41.43 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  43.75 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  37.88 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  42.42 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  37.88 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  44.29 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  40.91 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  43.75 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  35.82 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  42.65 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  41.79 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  39.06 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  39.06 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  39.06 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  39.06 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  41.43 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  41.43 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  40 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  42.19 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  35.94 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  34.85 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  37.5 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  41.94 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  34.85 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  35.94 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  39.06 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  35.94 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  34.85 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  41.79 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  34.85 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  35.94 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  32.81 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  35.62 
 
 		 264 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 		 517 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  36.36 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>