36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0840 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0840  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  221  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  35.16 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  32.04 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  35.06 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  29.21 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  33.78 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  33.77 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  29.87 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  30.26 
 
 
94 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  29.67 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  35.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  30.85 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  27.47 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  31.75 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  33.77 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  35.06 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  29.67 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  28.57 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  28.57 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  31.43 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  32.47 
 
 
94 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  32.35 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  30.86 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  32.47 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  30.43 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  31.25 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  31.88 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  24.68 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  34.62 
 
 
225 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>