25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02121 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  470  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  52.71 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  50.99 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  40.2 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  41.46 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  40.2 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  41.09 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  38.25 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  41.33 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  38.54 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  38.21 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  40.59 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  37.13 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  37.13 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  36.63 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  27.41 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  29.61 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  30.41 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  29 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  27.45 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  33.09 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46174  predicted protein  25 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>