25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2320 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  42.65 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  40.58 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  40.47 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  38.14 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  40.1 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  39.7 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  37.79 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  39.63 
 
 		 261 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  39.3 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  38.6 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  37.38 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  34.85 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  36.28 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  34.85 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  29.91 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  26.85 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  25.21 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  26.54 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  27.56 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  28.9 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46174  predicted protein  27.68 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>