25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1979 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  42.93 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  39.81 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  42.29 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  39.51 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  36.32 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  39.69 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  37.32 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  39.9 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  36.62 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  38.14 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  36.79 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  36.32 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  27.6 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  26.9 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  26.02 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  28.27 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  29.5 
 
 		 270 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46174  predicted protein  29.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>