25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5409 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  85.58 
 
 		 208 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  85.58 
 
 		 208 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  69.23 
 
 		 208 aa  294  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  55.12 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  54.63 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  55.67 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  51.72 
 
 		 221 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  55.45 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  52.76 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  51.98 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  37.79 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  35.89 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  37.86 
 
 		 261 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  36.63 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  33.17 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  31.4 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  27.41 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  26.53 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  30.5 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  31.5 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>