25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5525 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  87.5 
 
 		 216 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  63.72 
 
 		 221 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  66.67 
 
 		 214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  59.51 
 
 		 208 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  58.82 
 
 		 209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  56.6 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  56.6 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  54.07 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  55.12 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  54.76 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  40.2 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  42.45 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  36.49 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  36.19 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  34.52 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  33.87 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  30.96 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  28.93 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  28.78 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  30.89 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  33.09 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46174  predicted protein  27.43 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>