24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0929 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  537  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  44.39 
 
 
234 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  42.65 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  42.86 
 
 
226 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  36.41 
 
 
214 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  37.98 
 
 
216 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  40.2 
 
 
209 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  36.49 
 
 
216 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  37.02 
 
 
221 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  39.71 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  38.89 
 
 
213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  38.89 
 
 
213 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  39.2 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  37.86 
 
 
208 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  38.69 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  39.42 
 
 
228 aa  118  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  30.46 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  30.04 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  26.17 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  28.43 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  31.61 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  25.47 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>