24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6336 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  54.07 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  56.8 
 
 		 214 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  56.16 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  53.2 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  55.4 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  53.59 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  53.59 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  51.98 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  48.83 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  43 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  41.46 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  39.81 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  38.89 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  34.62 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  35.55 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  34.62 
 
 		 248 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  30.33 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  32.2 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  29.35 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  31.1 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  32.39 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>