24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4535 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  65.2 
 
 		 216 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  61.84 
 
 		 221 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  66.67 
 
 		 216 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  59.42 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  60.19 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  56.8 
 
 		 213 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  56.86 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  56.65 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  56.59 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  39.61 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  39.25 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  38.25 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  36.41 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  38.14 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  36.06 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  34.76 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  31.12 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  25.98 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  27.18 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  28.37 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>